Dans le cadre d’un partenariat d’échange de données entre l’ONEMA et le Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN) visant notamment à connecter les bases du SIE (système d’information sur l’eau) et du SINP (système d’information sur la nature et les paysages), 920 000 données des programmes de surveillance de la directive cadre sur l'eau (DCE) ont été transmises au SINP. Ces données concernent les espèces de macrophytes, diatomées, et invertébrés relevées par les agences de l'eau et DREAL entre 1992 et 2013 dans les cours d'eau français et collectées par l'ONEMA au travers du SIE. 280 000 de ces données correspondant à des identifications de présence au niveau spécifique ou inférieure sont aujourd'hui directement valorisables en ligne. Elles concernent 1 560 espèces différentes.